Depuis plusieurs années le Conservatoire mène des actions écopastorales dans le département de la Gironde.
Le Conservatoire des races d’Aquitaine travaille avec plusieurs éleveurs de la région pour préserver et valoriser la vache Bordelaise, race locale menacée d’abandon pour l’agriculture. Le « prix national de la Fondation du Patrimoine pour l’Agro biodiversité animale » a été créé en 2012 avec le soutien de Ceva Santé